主債權(quán)消失的主要原因有：清償、抵消、免除和主債權(quán)訴訟時效屆滿。“主債權(quán)訴訟時效屆滿導致抵押權(quán)消失”是物權(quán)法新增的規(guī)定。原擔保法司法解釋規(guī)定，主債權(quán)訴訟時效結(jié)束2年內(nèi)。擔保物權(quán)人行使擔保物權(quán)的，人民法院應予以支持。這就是說主債權(quán)訴訟時效屆滿并不必然導致抵押權(quán)消失。
民間借貸網(wǎng)表示，所有人抵押權(quán)分為兩種：
?、僭O立的所有人抵押權(quán)：所有人為自己在自己所有的債權(quán)上設立的抵押權(quán)；
?、诜ǘǖ乃腥说盅簷?quán)：我國擔保法規(guī)定的就是后發(fā)生的所有人抵押權(quán)，是指原來是他人的抵押權(quán)，但基于法定原因（如所有權(quán)與抵押權(quán)混同），該抵押權(quán)后為所有人取得。
我國擔保法所稱的所有人抵押權(quán)一般指法定的所有人抵押權(quán)，這樣規(guī)定的目的是為了保護特殊情形下所有人的收益。
例：如甲公司以價值300萬元的房產(chǎn)向銀行抵押貸款200萬元，并辦理了登記；此后，甲向乙借款200萬元，并約定以上述房產(chǎn)抵押，但未辦理抵押登記。如銀行借款先到期，甲尚欠銀行150元，與銀行協(xié)商，以該房產(chǎn)50%產(chǎn)權(quán)折價償還銀行的債務，則銀行與甲公司的債務關系消滅，銀行既是該房產(chǎn)的共有人，又是抵押人。銀行的抵押權(quán)則為所有人抵押權(quán)。乙債權(quán)到期后未受清償?shù)闹荒芤栽摲慨a(chǎn)另外50%產(chǎn)權(quán)的價款優(yōu)先受償，而不能以該房產(chǎn)的全部產(chǎn)權(quán)主張抵押權(quán)。
法律規(guī)定所有人抵押權(quán)制度的目的，旨在保護抵押權(quán)的次序利益。即抵押權(quán)在先的抵押權(quán)人在代償后，如抵押權(quán)消失，則順序在后的抵押權(quán)人反而因順序在前的抵押權(quán)人的清償行為而獲利，則失顯公平。